Η Παναγιώτα Ρούνη γεννήθηκε στην Τρίπολη και εισήχθη με Πανελλαδικές εξετάσεις μεταξύ των πρώτων στη Φιλοσοφική Σχολή του Ε.Κ.Π.Α., όπου ειδικεύτηκε στην Κλασική Φιλολογία και ανακηρύχθηκε πτυχιούχος με άριστα. Στη συνέχεια και παράλληλα με την ενασχόλησή της στο δημόσιο τομέα εξειδικεύτηκε σε επίπεδο μεταπτυχιακών σπουδών (2014) σε θέματα θεσμικού πλαισίου και πράξης του εκπαιδευτικού έργου. Στο ερευνητικό μέρος της διδακτορικής της διατριβής (2023) εστιάζει στη διοίκηση της εκπαίδευσης και ειδικότερα στα θέματα της εκπαιδευτικής αποκέντρωσης και της αυτονομίας της σχολικής μονάδας, του συνεργατικού μοντέλου διοίκησης και των σύγχρονων στιλ ηγεσίας του ανθρώπινου δυναμικού, ζητήματα που την απασχολούν και στην αρθρογραφία της. Είναι εγγεγραμμένη στο μητρώο του Κύριου Διδακτικού Προσωπικού του Εθνικού Κέντρου Δημόσιας Διοίκησης και Αυτοδιοίκησης (ΕΚΔΔΑ), ενώ διδάσκει και σε Μεταπτυχιακό Επίπεδο Σπουδών σχετικά με τα εν λόγω γνωστικά αντικείμενα. Τα τελευταία 15 έτη έχει υπηρετήσει σε διάφορες θέσεις ευθύνης (Προϊσταμένη Διεύθυνσης, Τμήματος, εισηγήτρια/μέλος συλλογικών οργάνων διοίκησης-επιτροπών, συμβουλίων και ομάδων εργασίας) στη Διοίκηση της Εκπαίδευσης σε κεντρικό επίπεδο (ΥΠΑΙΘΑ) με αντικείμενα σχετικά με την οργάνωση και διοίκηση της δημόσιας και της ιδιωτικής εκπαίδευσης στην Ελλάδα. Επίσης πολυάριθμες είναι οι συμμετοχές της σε επιμορφωτικά προγράμματα, σεμινάρια, ημερίδες και επιστημονικά συνέδρια σχετικά με τα ίδια θέματα.