Ο Χαράλαμπος Κουργιαντάκης είναι μέλος ΕΔΙΠ του Τμήματος Ιστορίας του Ιονίου Πανεπιστημίου, με αντικείμενο «Παιδαγωγικά-Διδακτική της Ιστορίας». Παράλληλα διδάσκει στο διαπανεπιστημιακό ΠΜΣ (Τμήμα Ιστορίας και Τμήμα Πληροφορικής του Ιονίου Πανεπιστημίου, Ίδρυμα Μείζονος Ελληνισμού, Ελληνική Μαθηματική Εταιρεία) με τίτλο «Ιστορική Έρευνα, Διδακτική και Νέες Τεχνολογίας» τα γνωστικά αντικείμενα Η Ιστορία ως αντικείμενο διδασκαλίας και Σύγχρονες τάσεις στη διδακτική της Ιστορίας, μαζί με τον Γ. Κόκκινο.
Στις δημοσιεύσεις του περιλαμβάνονται οι μονογραφίες Σχολική Ιστορία· ψυχής αγωγή ή οδύνη; εκδ. Απόστροφος, Κέρκυρα 2001, Το παρόν και το μέλλον του παρελθόντος, εκδ. Κέδρος, Αθήνα 2012 και Ασήμι στο ορυχείο, εκδ. Οσελότος, Αθήνα 2019, καθώς και εργασίες σε σχετικά επιστημονικά περιοδικά και συλλογικούς τόμους.
Επιστημονικά/ερευνητικά ενδιαφέρεται για ό,τι έχει σχέση με την Ιστορία ως αντικείμενο έρευνας και διδασκαλίας και, ιδιαίτερα, με την ψυχολογική-παιδαγωγική και πρακτική διάσταση της διδακτικής διαδικασίας.
