Ο Παναγιώτης Γατσωτής διορίστηκε ως φιλόλογος στη δημόσια δευτεροβάθμια εκπαίδευση το 1995, ενώ έχει υπηρετήσει ως στέλεχος της εκπαίδευσης σε διάφορες θέσεις (διευθυντής σχολείου, Συντονιστής Εκπαιδευτικού Έργου και Σύμβουλος Εκπαίδευσης Φιλολόγων). Έχει εκπονήσει μεταπτυχιακό δίπλωμα ειδίκευσης στη Σύγχρονη Ευρωπαϊκή Ιστορία (1995) και διδακτορική διατριβή στη Διδακτική της Ιστορίας (2005). Το συγγραφικό έργο του εστιάζεται στη διδασκαλία του μαθήματος της Ιστορίας και αφορά σε βιβλία και άρθρα (στα ελληνικά και στα αγγλικά) που έχουν συνταχθεί είτε ως μονογραφίες είτε στο πλαίσιο συγγραφικών ομάδων. Έχει επίσης συμμετάσχει σε ερευνητικό πρόγραμμα σχετικό με τη διδασκαλία του μαθήματος της Ιστορίας σε μαθητές-μαθήτριες ελληνικών σχολείων με μεταναστευτικό υπόβαθρο, συνεργάζεται με το περιοδικό Νέα Παιδεία-Γλώσσα και είναι ιδρυτικό μέλος του Ομίλου για την Ιστορική Εκπαίδευση στην Ελλάδα. Από το 2021 διδάσκει σε πανεπιστημιακό μεταπτυχιακό πρόγραμμα με αντικείμενο τα προγράμματα σπουδών Ιστορίας, ελληνικά και διεθνή